После того, как в 19-ом столетии руины Тракайского замка заинтересовали археологов и историков, этот замок стал важной туристической достопримечательностью Литвы.

Со второй половины 19-ого столетия в Литве постоянно разрабатывались планы по восстановлению Тракайского замка. Оригинальные фрески были законсервированы и скопированы Винсентом Смоковским. Императорская Археологическая Комиссия начала сбор документов, касающихся замка в 1888-ом году, а в 1905-ом году было решено частично восстановить руины замка. В течение Первой Мировой Войны немецкие специалисты сделали попытку восстановить некоторые части Тракайского замка. В 1935-1941 годах стены Княжеского дворца были укреплены, и южная замковая башня была перестроена, включая секции крепостной стены.
Литовские и польские археологи, а также защитники памятников истории, работали над проектом по восстановлению замкового комплекса, но работы были остановлены, когда началась Вторая Мировая Война. После войны в 1946-ом году основной проект по реконструкции замкового комплекса был возобновлен. Основные работы начались в 1951-1952 годах, и закончились в 1961-ом году. Тракайский замок был восстановлен в стиле 15-ого столетия. После окончания реконструкции замкового комплекса в нем было решено разместить Исторический музей, который работает до сих пор.

Туристы могут пройти по 16 экспозиционным залам музея и увидеть не только выставочный материал, касающийся истории замка и Тракайя, но и пройти по тайному княжескому ходу, а также посетить спальни и залы, которыми пользовались великие князи Литовские. В экспозиции музея представлены не только предметы искусства и обихода обитателей Тракайского замка, но и обширная экспозиция археологических артефактов. Замок открыт для посещения круглый год, однако с октября до апреля музей закрыт.